新冠肺炎

宣布Covid-19症状数据挑战

由Farzad Mostashari.

与Duke-Margolis卫生政策中心合作,决心拯救生命,卡内基梅隆大学和马里兰大学,催化剂@ Health 2.0很高兴宣布推出 Covid-19症状数据挑战。 Covid-19症状数据挑战正在寻找使用的新型分析方法 Covid-19症状调查 数据以提高较早的检测和提高公共卫生和公众爆发的情境意识。 

挑战如何工作:

在I阶段,创新者提交了一篇白皮书(“数字海报”)总结了使用症状调查公共数据的分析方法的方法,方法,分析,调查结果,相关数字和图表(有关更多的挑战提交标准)。评委将根据的条目评估 有效性,科学严谨,影响和用户体验 并授予五个半决赛者每年5,000美元。半决赛者将向评审小组提出分析方法,将选择三名半决赛选手进入II期。半决赛者将使用其分析方法开发原型(模拟或可视化)并在虚拟揭幕事件处呈现原型。法官将选择一个大奖获奖者和亚军(第2个)。大奖获奖者将获得50,000美元,赛跑者将获得25,000美元。获奖的分析设计将在Facebook数据上进行良好的网站,获胜团队将有机会参加与公共卫生代表的讨论论坛机构。 

I阶段I用于挑战的申请将到期 星期二,9月29日,2020 11:59:59 et.

了解有关Covid-19症状数据挑战的更多信息 这里.

挑战参与者将利用Carnegie Mellon University和Maryland大学的Covid-19症状调查汇总数据,与Facebook数据合作。方法可以集成公开可匿名的数据集以验证和扩展症状数据的预测效用,并应评估症状数据集成对识别国家,地方或区域Covid爆发的识别点的影响,同时引导个人和政策决策。 

这些是在公共卫生紧急情况下进行的最大,最详细的调查,迄今为止迄今为止有超过250万次,跨越200多个国家和地区和55种语言。挑战合作伙伴期待看到参与者提出的拟议方法,利用这一数据,欢迎对数据建模努力的有用性的欢迎反馈。 

Indu Subaiya.,Catalyst @ Health 2.0(“Catalyst”)联合创始人(“Catalyst”)与Farzad Mostashari,挑战椅,讨论Covid-19症状数据挑战的推出。 Indu和Farzad走过开放数据的运动,因为它与Covid-19大流行有关,以及挑战目标,合作伙伴,评估标准和奖品。

抄本:Farzad MostAshari对Covid19症状数据挑战

Indu Subaiya.: 一世’M很高兴今天与Farzad MostAshari谈论Covid-19症状数据挑战,与Carnegie Mellon大学的Delphi集团合作,以及马里兰大学的调查方法的联合计划。因此,谢谢您在推出这一挑战时在这里。帮助我们设定舞台,因为今年3月7日,你注意到纽约市的一些不寻常的事情。告诉我们这一点。

Farzad MostAshari.: 一世 was part of the first group of researchers 20 years ago to say “There’既然围绕着宇宙的一部分的所有这些数据’没有使用公共卫生目的。如果我们这样做了什么?“那个时候的紧迫性是大熊病和生物恐怖主义。

我们开发了这整个领域,被称为“综合征监测”,公共卫生监测,实时流行病学,我们就像那里一样,“如果你挖掘什么是怎么办什么’s正在进行并应用这些新的统计方法?”所以那个时候,我们抛光的石头是急诊室的访问和说,“我们可以收到有关纽约市发生的紧急房间访问的所有这些数据吗?“现在它是’S国家。并且能够跟踪,而不是诊断出任何案例,而是综合征。是否有呼吸系统综合症?呼吸困难吗?在社区中是否有流感样疾病?”我们设置了这些系统。我们在纽约市中心的其他事情之一,其中许多司法管辖区没有’做了,是我们创造了一个 公众面临透明工具 view of that.

所以10年后,我坐在我的地下室,就像这么多人担心什么’继续与covid。而现在当时在纽约市,有两种诊断的科迪德病例。但有很多令人担忧。我继续那个网站,它’一个公共网站,但人们刚刚没有’知道它。我点击了,我看到那些人用呼吸窘迫的人遇到呼吸窘迫,呼吸困难,咳嗽和发烧 翻了一番和三倍 就在过去的几天里。告诉我是什么,纽约市没有两箱Covid。有成千上万的病例和它们’每三天都会加倍。

这次实现工作两周,当学校被关闭时,当城市被关闭时。这里的承诺和前提是,如果我们相信这些信号,如果这些信号是值得信赖的信号,我们不’不得不有数十万人感染和成千上万的人死亡。我们可以迅速进行干预。公众和政策制定者可以根据更及时的数据做出决定。

Indu Subaiya.:几乎存在三个必要的因素,以至于您的这种愿景’真的很开心。一个是你需要打开的数据。您需要访问您的数据’vere始终在纽约市和其他地方福音。您需要有提前检测和预警的机制。但是在那里’s something else you’vers始终倡导,这是公民科学家的参与。因此,愿景的基础是如何聚集在一起设计这一挑战。

Farzad MostAshari.:所以我得知这个令人难以置信的努力’正在进行的情况下,没有人知道(到第一阶的近似值),这是每周在全球范围内完成数百万的调查,其中70个加上国家,以及美国的每个州和领土,每个人都有数百万人一天,他们去Facebook,他们看到那里 ’有机会从外部大学,卡内基梅隆或马里兰大学进行全球数据进行调查。他们点击了,他们离开Facebook,他们转到这个其他网页,他们填写了一个 民意调查 问周围的问题,“你在过去24小时里有症状吗?你家里有人吗?你认识人[谁有]?你穿面具吗?你出去的时候有小心吗?” And they’回答这些问题’实际上在统计上称重’它不是一个方便的样本,它’没有任何恰好在家里或其他任何东西都有温度计。它’s的实时,信息可靠。但它’s not being used!

汤姆弗里登,我的前老板和现在领先 决心拯救生命 (一个美妙的全球公共卫生组织)和我被带来了对这项努力的看法。我们都喜欢,“这真太了不起了。你应该把它推出来。”他们将数据推出在开放式API中。任何人都可以去 Delphi CMU.。三个月后,它’仍然不是我们的数据万神经的一部分’使用来评估什么’S发生在Covid。尽管所有其他数据系统中的所有缺点,但人们都在’t using it.

而且我想到了你的观点,数据就在那里,但抛光石头的参与’发生了。它的验证’发生了因为我们不’T有足够的眼睛。它没有融入人们’了解他们应该做的事情。 “我应该把孩子送到学校吗?我应该去商店吗?我本周戴面具吗?“这些是真正的决定,真正的人每天都要做,我们’重复没有给他们一个可能是真正的比赛更换器的东西的好处。

Indu Subaiya.:好吧,我们’在某些早期分析中,ve先见了这一数据。对你的一些见解说一点’在症状数据可以告诉我们一些不同的东西和早于案例率,死亡率,我们的数据输入’RE目前习惯了,因为这可以做得更好。

Farzad MostAshari: 是的。理论上,让’思考优势。在三大数据来源上,如果我对你说,一个公民科学家,“How do we know what’我们在社区中的covid?我们如何知道是否发生爆发?我们如何知道爆发是否达到峰值?我们如何知道它是否’s coming down?” There’我们试图查看的三个数据来源。所有三个都有缺陷。第一个显然是我们有多少诊断案件。案例编号,案例积极性,实验室测试。嗯,这是我们早期的实验能力少的问题。没有伟大的实验能力,仍有国家和世界各地的部分地区。实验室容量正在发生变化。即使我们进行测试,他们也是’重新延迟七到10天。

阳性可以’必然会依赖于任何一种,因为它取决于你的人口’测试。如果你打开一堆年轻人的测试,你可能有不同的速度。如果您开始测试无症状的人,您可能有不同的费率。如果人们遵循CDC’S推荐和他们停止测试渐近,你可以增加… So it’非常依赖于测试行为。你’通过这种测试行为的镜头来看它,并且该镜头可以扭曲。

第二个数据来源可能是死亡的。死亡是高度可靠的。他们’仍然是下降的。我们的科学委员会成员之一,Dan Weinberger和一群其他研究人员和我发表了一个 文章 与covid死亡相比,看着多余的死亡。和那里’在那两个之间的实际差异,但死亡是一个非常硬的数据点。问题是’周延迟了。如果我们等待直到我们看到死亡说我们有问题,爆发会在我们甚至可以解决它之前通过一个城市狂奔。

然后,现在的第三个传统监测的来源是我们20年前开创的综合征监视,急诊室,住院,综合征数据。而那些问题是你的镜头’通过寻求健康寻求行为的人来看。如果人们改变他们去急诊室的可能性,请去医生’■办公室,它掩盖了镜头。

因此,随着所有三个,症状调查数据都具有独特的优势。与死亡相比,它’更及时。实际上,与任何其他数据源相比,您希望它成为第一个指标。它’与健康寻求行为或测试可用性完全无关。如果您认为,特别是在全球背景下,有许多国家实验室能力真正受到挑战,甚至死亡监测,死亡率监督都是真的挑战。这可能是一个主要工具。

据说,我们现在拥有的是 非常初步的证据 这可能是有用的。我们是谁’重新寻找许多人,更多的人能够将目光放在数据上并找到抛光那些石头的方法,以获得使用这些信息的最高价值方式,为社会提供。

Indu Subaiya.: 从今天的世界各地的所有公民科学家都可以通过API进入这些数据集 总CSV。和法拉德,他们的主要挑战是什么问题’LL能够与之搞并解决?

Farzad MostAshari.:我们的主要问题 ’Re询问您是否可以找到一种方法来验证是否在症状数据中添加到所有其他现有数据源中我们可以提高灵敏度,特殊性,我们检测到什么的能力’继续爆发。什么是拐点?什么时候起飞?什么时候平坦化?什么时候下来?并能够为政策制定者和公众提供有用的信息指导其决定。

所以我们’把它留下宽阔,对吧?伴随您的方法,随身携带。你想在年龄分层的基础上看待它吗?你想用实验室数据组合它吗?你想融合面具磨损信息吗?你想在太空中考虑它的粒度吗?你想看看县级,人力资源水平,国家级吗?你想在时间方面看看吗?你想在一周或白天看看吗?所有这些,您想应用统计方法,聚类方法吗?你搞清楚了。 但回答问题:“如何将这些数据纳入公共卫生监控工具的万神经中的最佳案例是什么?”

Indu Subaiya.: 虽然我们有学者,如果你愿意,努力,我们’re真的寻找所有的chers。

Farzad MostAshari.:所有的角度。

Indu Subaiya.: 即使你’Re不是训练有素的流行病学家,但您对此数据感兴趣,我们正在截至今天可用。和参赛者将有四周的时间来分析。然后我们’LL有一些将向科学委员会提供的半决定主体。此时,最多可选择五支球队,以便进入第二轮’LL建立可视化和模拟,此分析的原型。因此,当参赛者在前四周后提交分析时,科学委员会将看出某些标准。人们可以预期提交的是什么?

Farzad MostAshari: Well, I think it’有点就像有一个特别的期刊。我们赢了’因为我们将是一个真正的期刊文章,但我们是一个真正的杂志’基本上正在进行评估结果的有效性。

有多令人信服是证据’s在添加症状数据的额外效用方面呈现?什么是使用的方法?第二个是对这些分析进行的严谨性。他们是否认为有偏见的混淆,一些其他潜在的错误关联原因?那有什么局限性?第三是影响。

如果有’s a method that’S如此复杂,需要20天才能每天运行’嗯,嗯,那个数据’没有会产生影响。但是影响的真正可能性是什么?

与之相关,但不同的是用户体验。解释有多容易?想象化有多容易?它是如何让可操作的那些结果来自分析?这些 四个标准 将在第一阶段使用。然后,当我们做演示文稿然后与最终结果一起时,我们选择大奖赛…它是什么,50,000美元?那’s huge!

Indu Subaiya.: 那’右。第二名是25,000美元。

Farzad MostAshari.:25,000美元!这些水平中的每一个是相同的标准。

Indu Subaiya.: 极好的。我也想提醒人们,只要它可以带来外部数据’S公开可用,以便我们可以继续为此数据库提供数据库,并希望在一起真正将这种疫情打击。

所以Farzad,我们可以帮助参赛者了解所提供的数据集的方式之一’这么多合作伙伴在这里。这些数据集来自哪里,隐私工作如何赋予人们采取这些调查?

Farzad MostAshari.:建议对在Facebook上的人们建议进行调查。但是,当有人点击那个说的横幅广告时‘你想参加covid调查吗?’他们完全离开Facebook环境,他们去马里兰大学或卡内基梅隆’s website.

我认为它’对于人们来说,对人们来说,来自大学所做的那些匿名调查的重要性。无法访问Facebook的人员的线路级数据。他们不’t want it, they don’t have it.

但是,大学研究人员实际上可以获得这种微量数据。但是,有来自的提取物,这是一种匿名的,通过API的各种粒度下的各级粒度的最小单元格大小,我们也将使CSV下载提供。

那些完全匿名,完全汇总。没有人’S身份显然将受到影响,只是说“本周在这个县,有这么多人抱怨近期咳嗽症状”等等。

这是其中的一部分 Facebook数据很好 项目,我当然认为这是良好的数据。

Indu Subaiya.:而Farzad,你的希望是什么,因为这些团队出现了这些想法?这些发现可以部署在哪里?你在挑战之外,你从这里追求的愿景是什么?

Farzad MostAshari: 我们的希望是,这些人成为了与死亡和案例和住院的一部分,它’只是人们看的一部分。所以当你去的时候 covid跟踪 或者 Covid退出策略 或者 霍普金斯网站 或者 CDC或者当国家或城市或州长正在寻找数据时,这是他们也考虑的因素之一。而且还有公众。正如Tom Frieden喜欢的那样,“当你检查天气时,看看你是否应该采取雨伞,你应该检查一个告诉你什么的网站’在您的社区中继续进行Covid活动“ -  这可以帮助指导许多我们必须每天制造的许多决定,直到我们有畜牧业或疫苗,或两者。”

Indu Subaiya.: 绝对地。因此,这一挑战所需的真实,非常有影响的结果。它’不仅仅是一个学术练习。评估决赛选手的人们将寻找如何将这些算法和这些可视化用于其公共卫生仪表板中的决策过程。所以’是一个非常令人难以置信的令人兴奋的机会。

这一挑战所做的一件事就是邀请人们加入一个松懈频道,以便他们可以互相通信。我们不 ’认为这是一个一次性提交,然后离开你去,但真的是聘请社区的手段。那’始终是你的最前沿’与健康技术界的福音传播。

Farzad MostAshari.:我们都没有像我们所有人那么聪明。

Indu Subaiya.: 我们’我今天去活着。我只是想有机会,法拉德,分享它背后的愿景以及什么好看起来。所以我们 ’重新兴奋地帮助在催化剂中支持挑战机制本身。非常感谢你。

Farzad MostAshari: 并感谢您和团队帮助赞助这一点。我希望参赛者有一个美好的体验。

Farzad MostAshari是Aledade,前国家健康信息技术协调员和纽约市健康和精神卫生部的前副局长的首席执行官

印刷精美: 参与受官方规则无需进入/获胜所需的购买。购买不会增加您的获胜机会。入境截止日期9月29日,2020年11:59:59 PM EDT。向美国和全球开放的法律居民,他们至少是他们居住的司法管辖区的多数,不包括克里米亚,古巴,伊朗,叙利亚,朝鲜,苏丹或其他国家或地区的国家或其他国家或地区。在法律禁止的地方无效。参与受事项 官方规则。查看入学要求的官方规则,判断标准和全面详细信息。管理员:Health 2.0 LLC。赞助商:Facebook,Inc。Partners:Duke Margolis卫生政策中心,卡内基梅隆大学,马里兰大学,决心拯救生命。

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